结直肠癌患者癌组织定植菌群结构与组分变化分析

作者：徐蓉; 孙祖俊; 商安全; 吴军录; 李冬^*

来源：中华检验医学杂志, 2019, (01): 44-50.

• 结直肠肿瘤
• 肠黏膜
• 胃肠道微生物组
• 高通量核苷酸序列分析
• 生物标记,肿瘤

目的 探讨结直肠癌患者癌组织定植菌群结构和组分变化,分析肠道定植菌群与结直肠癌发生发展的关系。方法 回顾性研究。收集2016年1月至2017年10月同济大学附属同济医院院行胃肠外科手术的乙状结肠28份位置匹配的组织样本为结直肠癌组,同期收集12份健康体检者正常肠黏膜组织样本为对照组。采用Illumina Miseq测序技术进行细菌16S rRNA基因V3-V4区测序,分析并比较正常肠黏膜组织和癌组织定植菌群结构与组分差异。统计学方法采用Mann-Whitney检验。结果 正常肠黏膜组织与癌组织定植菌群的结构存在显著差异。在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes)在癌组织中的丰度显著偏低(Z=-1.964,P<0.01),而变形菌门(Proteobacteria)在癌组织中的丰度则显著偏高(Z=-1.997,P<0.01)；在属水平,拟杆菌属(Bacteroides)、布劳特菌属(Blautia)、普雷沃菌属(Prevotella)和普拉梭菌(Faecalibacterium)等在癌组织中的丰度明显低于正常肠黏膜组织(Z=-3.008,P<0.05)；仅在正常肠黏膜组织定植且丰度排前3位是布赫纳什菌属(Buchnera)、普氏菌属(Prevotella)和普雷沃菌科(Prevotellaceae),仅在癌组织定植且丰度排前3位是卡氏菌属(Catonella)、库特菌属(Kurthia)和短单胞菌属(Brachymonas)。结论 通过鉴定肠黏膜组织定植菌群结构及成分变化可能成为一种准确、低成本的CRC早期诊断指标,从而为CRC的预防和治疗指明新的途径。

• 单位
  上海市临床检验中心; 同济大学; 同济医院