通过生物信息学分析鉴定干燥综合征的关键基因

作者：郭俊恺; 赵承磊; 赵兴旺; 王娟; 葛兰; 宋志强; 游弋^*

来源：中国麻风皮肤病杂志, 2021, 37(03): 131-152.

• 生物标记
• 基因表达谱
• 干燥综合征

目的:使用生物信息学方法鉴定干燥综合征(SS)的关键差异表达基因(DEGs)。方法:从基因数据库中下载GSE23117和GSE127952的基因表达谱,用GEO2R在线工具和Venn软件筛选出其中的DEGs。通过DAVID网站进行GO和KEGG分析。使用STRING工具建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,用Cytoscape软件进行模块分析。结果:在SS标本中总共检测到31个DEGs重叠区域。其中28个上调基因和3个下调基因主要在免疫炎症中起作用。KEGG分析显示DEGs与细胞因子-细胞因子受体相互作用、趋化因子信号通路、阿米巴病和白细胞跨内皮迁移有关。PPI和模块分析显示CXCL9、CXCL11、CXCL13、CCR1、CD69、PTPRC、GPR183、MMP9和IL-10基因显著富集。结论:CXCL9、CXCL11、CXCL13、CCR1、CD69、PTPRC、GPR183、MMP9和IL-10可能与SS的发生和进展有关。

• 单位
  中国人民解放军陆军军医大学; 第一附属医院皮肤科