科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
弓獭蛤（Lutraria rhynchaena）是我国南方沿海重要的海水养殖贝类，为探讨弓獭蛤不同组织的基因表达差异，本研究采用RNA-seq测序技术对北部湾海域弓獭蛤7个组织（肌肉、外套膜、鳃、肝胰腺、虹吸管、雌性性腺和雄性性腺）进行转录组测序及生物信息学分析。结果显示，21个样本共获得939 197 518条质控后序列，各组织质控后碱基数为15.39 -29.26 G。测序结果经过Denovo组装和ORF查找共获得56 773个Unigenes。在5个公共数据库NR、GO、eggNOG、KEGG和SWISS-Prot对比各注释分别得到24 557、13 094、17 524、10 352和13 857条有效注释信息。本研究获得了大量弓獭蛤组织间的差异表达基因，丰富了弓獭蛤的基因数据库，为更深入地了解弓獭蛤各组织功能，进一步挖掘和开发利用弓獭蛤功能基因提供基础数据。
- 单位
