石榴种质资源的matK基因序列分析

作者：马丽; 周玉亮; 郝兆祥; 丁城实; 侯乐峰^*; 康美玲; 罗华

来源：分子植物育种, 2020, 18(16): 5274-5279.

DOI：10.13271/j.mpb.018.005274

• matK基因
• 石榴品种
• 遗传关系
• DNA条形码

本研究以60个石榴品种为材料,PCR扩增获得石榴品种的matK基因片段,分析石榴资源的matK基因序列的碱基组成、序列间碱基变异频率和转换/颠换比率;计算品种间遗传距离(K-2P),构建遗传关系分类图,研究matK基因序列对石榴品种鉴定的效果。结果表明,石榴物种的matK基因片段容易获得,PCR扩增成功率为98.3%,测序成功率为100%,59个石榴品种matK基因片段最长为897 bp,最短为820 bp。石榴的matK序列保守性为95.8%,G+C含量相对稳定,平均含量为33.3%,A+T平均含量高达66.7%,密码子偏好A和T;序列碱基存在转换/颠换比率为1.003,核苷酸多样性为0.000 8,每位点核苷酸多态性指数Theta值为0.000 54。K-2P遗传距离在0.000～0.024之间,平均遗传距离为0.007,邻接法(NJ)构建59个品种遗传关系聚类图,59个品种被分为6大类,分类结果与形态学和品种地理来源分类没有明显相关性。

• 单位
  生命科学学院; 南京信息工程大学滨江学院; 枣庄学院