基于单细胞RNA测序探讨肾SOX9阳性祖细胞转录组特征

作者:吴日宝; 陈良颢; 景子涵; 邹春林*
来源:广西医科大学学报, 2023, 40(04): 624-630.
DOI:10.16190/j.cnki.45-1211/r.2023.04.015

摘要

目的:基于单细胞RNA测序探究人正常肾脏中SOX9阳性祖细胞的转录组特征,为肾脏再生医学研究提供依据。方法:从GEO数据库中收集已发表的人类正常肾脏的单细胞RNA测序数据,结合差异基因分析、功能富集分析和拟时序分析探究SOX9阳性祖细胞的转录组特征,通过免疫组化实验和免疫荧光实验验证相关分析结果。结果:在人正常肾脏组织中,SOX9阳性细胞主要存在于近端小管中;GO分析结果显示,近端小管中的SOX9阳性细胞仍维持祖细胞样特性;进一步的亚群分析显示,近端小管SOX9阳性细胞可分为C1、C2和C3 3个亚群,其中C2亚群高表达SOX4、HES1、MYC、KLF4等与干细胞状态维持的相关基因,并在SOX9阳性细胞分化轨迹中处于起始位置。结论:人正常肾脏SOX9阳性细胞中仍有一部分细胞维持祖细胞样特性,具有潜在的再生医学研究价值。

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