草菇锰过氧化物酶编码基因生物信息学分析及其转录水平和酶活性的测定

作者：朱刚; 吴林; 陈明杰; 汪虹; 谭琦; 鲍大鹏

来源：菌物学报, 2013, (05): 919-927.

DOI：10.13346/j.mycosystema.2013.05.019

• 草菇
• 锰过氧化物酶
• 生物信息学
• RT-PCR Volvariella volvacea
• manganese peroxidase
• bioinformatics
• RT-PCR

在草菇全基因组中发现了4个担子菌锰过氧化物酶MnP基因同源物(vv-mnp1、vv-mnp2、vv-mnp3和vv-mnp4)的基础上,对这4个MnP进行了生物信息学分析,并对其基因表达和酶活性进行测定。结果表明vv-mnp1与vv-mnp2基因结构相同,vv-mnp3与vv-mnp4基因结构相似。在4个草菇MnP基因启动子区域存在AP-2、cAMP、MRE、XRE和HSE等调控元件,预示着草菇中MnP基因的转录可能会受到氮源、碳源、重金属离子、芳香族化合物以及热击的影响。草菇MnP具有信号肽,不存在跨膜区域,表明其是分泌蛋白。草菇MnP中形成4个二硫键的8个半胱氨酸、潜在的锰离子和钙离子结合...

• 单位
  上海市农业科学院食用菌研究所; 上海海洋大学