公立医院的经营性质决定着财政专项资金是其主要资金来源之一,而且随着国家对于卫生医疗事业的重视,对公立医院的投入也在逐步加大,因此医院有关财政专项资金的核算和管理工作更为重要。本文探讨分析了在新政府会计制度实施后公立医院有关财政资金会计核算的主要内容及重点关注事项,并提出了加强财政专项资金会计核算管理的建议,以保证医院相关核算的准确性和财政资金使用的高效性。