水稻低温胁迫响应microRNA鉴定

作者:罗樊; 周建平; 雷万喜; 谭峻文; 郭亚冲; 全泉; 蔡光泽*
来源:西昌学院学报(自然科学版), 2021, 35(04): 1-18.
DOI:10.16104/j.issn.1673-1891.2021.04.001

摘要

水稻是世界三大粮食作物之一,然而低温胁迫会严重抑制水稻的生长发育。为了探究microRNA在水稻低温胁迫中的作用,采用低温处理前、5℃低温处理24 h和5℃低温处理48 h的2~3叶期水稻整株,构建9个小RNA文库。通过高通量测序后,对9个小RNA文库的microRNA进行差异表达分析,一共筛选出21个与冷胁迫相关的microRNA,其中16个在冷胁迫下上调,5个在冷胁迫下下调。通过对这21个microRNA靶基因的GO富集结果表明,其靶基因广泛富集在包括信号转导、免疫系统和物质合成等细胞内过程中。这表明水稻可能通过多种microRNA介导,从各个方面来协同抵御低温胁迫。本研究为进一步阐明microRNA响应低温胁迫的分子机制提供了基础,且本研究所鉴定的microRNA为增强水稻对低温耐受性遗传改良提供了优异的miRNA资源。

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