SSR引物及多态性位点数对陆地棉野生种系聚类结果的影响

作者：高伟; 王坤波; 刘方; 王春英; 张香娣; 王玉红; 黎绍惠

来源：植物遗传资源学报, 2013, (02): 237-242.

DOI：10.13430/j.cnki.jpgr.2013.02.021

• 陆地棉
• 野生种系
• SSR
• 引物
• 多态性位点
• 聚类 Gossypium hirsutum Linn
• race
• primer
• polymorphic allele
• cluster analysis

利用SSR标记分析陆地棉野生种系的遗传多样性,对材料间相似系数的变异系数进行显著性测验和矩阵相关性测验,探讨引物和多态性位点数对研究结果准确性的影响。90对多态性引物在42份供试材料间共检测出530个等位位点,其中多态性位点440个,占83.01%。多态信息含量范围为0.046～0.888,平均为0.649;Shannon多样性指数在0.113～2.289之间变动,平均为1.248。显著性测验显示,当引物按PIC值降序排列时,利用25对引物或者150个多态性位点即可获得较准确的结果;升序排列时,至少需要50对引物或200个多态性位点才能获得较准确的结果。矩阵相关性测验显示,降序时20对、升序时...

• 单位
  棉花生物学国家重点实验室; 中国农业科学院棉花研究所