深度学习在碱基识别中的应用研究

作者：柴合丹; 林新然; 邓慧敏; 张中军

来源：周口师范学院学报, 2021, 38(05): 55-61.

DOI：10.13450/j.cnki.jzknu.2021.05.013

• 碱基识别
• 测序
• 深度学习
• 神经网络

在生物学研究中把测序仪原始的测序文件转换成碱基序列的过程称为碱基识别(base-calling)。作为新一代的测序技术MinION根据单分子DNA/RNA通过纳米孔的电流变化进行碱基序列的判断。MinION具有测序读长长、无需PCR扩增以及理论上能做到实时测序等优点。但其最大的缺点是碱基识别的准确率不高。为了解决该问题,提高碱基识别准确率的算法研究成了热点。本文主要对近年来提出的基于深度学习的碱基识别方法进行了对比研究。

• 单位
  周口师范学院