人体肠道内定值着多种多样的微生物，这些微生物对人体健康影响很大。研究发现，健康人群与患病人群在肠道微生物群落组成上存在着差异性。元基因组学研究的出现，为找出这些差异提供了可能。元基因组学研究微生物群落结构组成不需要将微生物个体分离出来，而是作为一个整体进行元基因组测序研究。通过对元基因组测序数据分析，得到微生物群落结构，为疾病诊断提供依据。
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