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摘要
目的探索成釉细胞瘤与牙源性角化囊肿间的差异基因,并进一步分析其功能,最终探寻成釉细胞瘤侵袭生长的机制。方法从GEO数据集下载基因芯片数据GSE38494,运用R语言中的LIMMA数据包进行成釉细胞瘤和牙源性角化囊肿间的差异基因分析。借助DAVID数据库对差异基因进行GO分析和KEGG通路富集分析。STRING网站进行差异基因PPI网络构建,Cytoscape软件对其结果进行可视化,并使用MCODE插件筛选其中的关键基因。结果通过分析,我们获得了335个差异基因。GO分析表明差异基因主要影响神经元分化、细胞粘附、生物粘附、与分化有关的细胞形态发生、细胞形态发生、细胞命运锁定等生物过程;富集的细胞组成主要是细胞外区、细胞外基质、细胞外组分、蛋白质类细胞外基质、细胞外基质结构的构成、突触等;富集的分子功能主要参与碳水化合物结合、肝素结合和转录因子活性等。KEGG通路分析发现差异基因主要参与细胞外基质-受体相互作用、轴突导向和癌症通路等信号通路。8个关键基因为SPARCL1、SERPINA1、ITIH2、IGFBP5、LAMB1、C3、GOLM1、FAM20A。结论利用生物信息学筛选出成釉细胞瘤和牙源性角化囊肿间的差异基因。8个关键基因有望成为两者之间鉴别诊断的新标志物,并为成釉细胞瘤的研究提供了新思路。
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