基于网络药理学探讨八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的作用机制

作者：瞿颖; 向科旭; 王蓓茹; 侯铖宇; 王继勇

来源：新中医, 2023, 55(24): 119-128.

DOI：10.13457/j.cnki.jncm.2023.24.023

• 食管癌
• 肿瘤微环境
• 八珍汤
• 生物信息学
• 网络药理学
• 分子对接技术

目的：基于网络药理学和生物信息学探讨八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的作用机制。方法：收集中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）中八珍汤组方药物的有效成分及其靶点，从TCGA数据库下载食管癌患者的转录组数据和临床信息，根据ESTIMATE算法计算食管癌样本的基质评分、免疫评分、综合评分，筛选食管癌肿瘤微环境预后相关基因，将这些基因作为重塑食管癌肿瘤微环境的相关靶点。最后将中药靶点和疾病靶点取并集，获得八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的相关靶点，并通过Cytoscape 3.9.1构建“中药-成分-靶点”网络。基于STRING 11.5数据库及Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络并通过Cytoscape 3.9.1的插件CytoHubba筛选核心基因，运用DAVID数据库对中药与疾病共有靶点进行基因本体（GO）富集分析以及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路分析，并对药物有效成分和核心基因进行分子对接验证。结果：获得八珍汤重塑食管癌肿瘤微环境的31个相关基因，根据MCC算法筛选得到前5个较为重要的基因：ICAM1、CCL2、CXCL10、STAT1、VCAM1。GO功能、KEGG通路富集分析结果显示，中药-疾病共有靶点基因主要富集于趋化因子信号通路、TNF信号通路、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示，八珍汤药物主要有效成分和核心靶点蛋白有良好的结合力。结论：八珍汤可能通过靶向ICAM1、CCL2、CXCL10、STAT1、VCAM1等关键基因调控趋化因子、TNF、NF-κB等信号通路重塑食管癌肿瘤微环境，从而影响食管癌细胞生长、侵袭转移、血管生成、化学耐药等。

• 单位
  湖南医药学院第一附属医院; 广州中医药大学; 广州中医药大学第一附属医院; 第一临床医学院