宏基因组高通量测序在难治性尿路感染诊治中的应用3例

作者：齐尔; 刘立; 谢珍; 张楷乐^*; 傅强

来源：临床泌尿外科杂志, 2022, 37(11): 869-871.

DOI：10.13201/j.issn.1001-1420.2022.11.014

• 尿路感染
• 宏基因组
• 下尿路症状
• 病原微生物

尿路感染是泌尿外科的常见疾病，然而许多患者表现为顽固性、难治性或慢性尿路感染症状，对生活与工作造成巨大影响。目前临床中的常用检测为尿常规、中段尿培养等，存在较高的假阴性发生率。宏基因组测序高通量测序(mNGS)以往多应用于肿瘤和遗传病诊断，在尿路感染方面尚未开展，本研究探索了mNGS在顽固性尿路感染治疗中的应用价值。3例顽固性尿路感染女性患者，年龄分别为25、26和57岁，尿常规、尿三杯和中段尿培养无明显病原体证据，经过经验性用药无明显缓解。患者进行中段尿液样本采集和mNGS检测，通过基因序列分析细菌、真菌、病毒等基因，并提供耐药基因报告。随后进行敏感性药物应用，每周进行随访，收集患者主诉和尿常规、尿培养报告。治疗成功标准为患者主诉下尿路症状好转、尿常规和尿培养阴性。3例患者的mNGS检测均发现了多种微生物感染和耐药基因，使用敏感抗生素治疗后症状明显好转。以上病例提示，mNGS能够发现常规尿液检查无法获得的病原微生物数据和耐药基因数据，对指导临床药物选择、缩短患者感染病程、减少抗生素的经验性滥用有促进作用，可作为常规病原学检测无法解释的复杂性尿路感染，以及排除病因不明的下尿路症状患者的可选性检测方法。

• 单位
  上海市第六人民医院