狗枣猕猴桃(Actinidia kolomikta)查尔酮合酶AkCHS1生物信息学分析

作者：李然红^*; 陈鑫; 刘丹; 王立凤

来源：分子植物育种, 2020, 18(03): 811-816.

DOI：10.13271/j.mpb.018.000811

• 狗枣猕猴桃
• 查尔酮合酶
• 生物信息学

查尔酮合酶(chalcone synthase, CHS)是类黄酮合成途径的关键酶和限速酶,在植物花色素苷形成中具有重要作用,并参与植物的育性、机械损伤的防御反应等。本研究利用生物信息学方法在RNA-seq数据中获得了狗枣猕猴桃查尔酮合酶基因(AkCHS1)的序列信息,并对AkCHS1进行结构及功能预测。结果表明,狗枣猕猴桃AkCHS1的c DNA全长为1 577 bp,CDS为1 167 bp,编码蛋白由389个氨基酸构成,具有CHSlike的保守序列,是查尔酮合酶(PLN03169)超家族的一员,是一个亲水性、稳定的蛋白。与其他19种植物的查尔酮合酶氨基酸序列进行对比,结果表明,狗枣猕猴桃AkCHS1与中华猕猴桃及其变种亲缘关系较近,而与桑树、柑橘等植物亲缘关系较远。本研究为狗枣猕猴桃AkCHS1基因功能的进一步研究提供了参考。

• 单位
  牡丹江师范学院