16S rRNA基因序列分析在非典型菌株鉴定中的应用

作者：张守印; 李振军; 张集; 朱勇; 庞慧; 郑宵; 贺金荣; 海荣

来源：中国卫生检验杂志, 2008, (04): 616-617+726.

• 16S rRNA基因
• 序列分析
• 非典型菌株 16S rRNA gene
• Sequence analysis
• Atypical strains

目的:建立16S rRNA基因序列分析鉴定细菌的方法,评价其对常规方法不能鉴定菌株的鉴定效果。方法:选择细菌的16S rRNA基因为靶序列,在两端保守区设计引物,对三株生化、形态不典型菌株提取模板进行PCR扩增,PCR产物纯化后进行克隆,测序。结果:三株细菌的16S rRNA基因序列与Genbank比较,YC1序列与大肠杆菌相似性>99%,YC2序列与肺炎克雷伯菌相似性>99%,YC3序列与缓症链球菌相似性>98%。结论:16S rRNA基因序列分析的方法可以较好地鉴定常规方法难以鉴定的不典型菌株。

• 单位
  The University of Texas Medical Branch; 中国疾病预防控制中心; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所; 传染病预防控制国家重点实验室