一株类志贺邻单胞菌噬菌体生物学特性及全基因组分析

作者：何洋; 秦旭颖; 荆兆元; 杨洪江^*

来源：微生物学报, 2022, 62(02): 650-660.

DOI：10.13343/j.cnki.wsxb.20210288

• 类志贺邻单胞菌
• 噬菌体
• 基因组学
• 比较基因组学
• 分类学

【目的】多重耐药菌株的出现给食品安全带来严重威胁。噬菌体是不同于抗生素的一类重要杀菌因子,对其生物学特性及基因组的研究和分析可为噬菌体的抗菌应用提供依据。【方法】对噬菌体phiP4-7的生物学特性、基因组学、分类学进行研究。【结果】经透射电子显微镜观察,确定phiP4-7头部直径为(50.59±1.68) nm,尾部长度为(76.53±4.90) nm,属于长尾噬菌体科;一步生长曲线结果表明,其潜伏期时间约为25min,每个感染中心释放的噬菌体数量约为63 PFU/infection center;抑菌曲线结果表明,phiP4-7能够有效地抑制宿主菌的生长。基因组测序组装结果显示,phiP4-7基因组长度为39 825 bp,GC含量为48.67%。通过生物信息学软件对基因组进行注释,发现phiP4-7的基因组上共编码72个蛋白,不编码tRNA基因,未发现已知的耐药基因和毒力基因。比较基因组学和分类学结果显示,将其归类为长尾噬菌体科中的一个新属。【结论】分离得到了一株新类志贺邻单胞菌噬菌体,并对其生物学特性和基因组进行了分析。

• 单位
  生物工程学院; 工业发酵微生物教育部重点实验室; 天津科技大学