虎源副流感病毒5型的分离鉴定及全基因序列分析

作者：陈安妮; 李冰; 霍礼侠; 吴佳骏; 邹舒展; 陈武^*; 罗满林^*

来源：中国兽医科学, 2019, 49(03): 309-316.

DOI：10.16656/j.issn.1673-4696.2019.0039

• PIV5
• 病毒分离鉴定
• 基因组测序
• 序列分析

本研究旨在了解虎源副流感病毒5型(parainfluenza virus 5,PIV5)的遗传变异情况,阐明其基因组与遗传进化等特征。从广东省某动物园疑似虎PIV5感染的病料处理后接种Vero细胞并通过一系列的鉴定,将分离的毒株命名为HMZ。根据GenBank中PIV5基因序列,设计包含全长的12对特异性引物,并扩增其全基因组。将扩增产物克隆到pMD-18T载体上,对鉴定为阳性的重组质粒送检测序,并对基因全序列进行同源性分析及遗传进化分析。结果显示,HMZ与各病毒株全基因序列同源性为97.2%～99.8%。其中与1168-1 (KC237064.1)、ZJQ-221 (KX100034.1)以及Mammalian rubulavirus 5 (KY685075.1)亲缘性最高,为99.8%;而与D277的亲缘性最低,为97.2%。全基因系统进化树分析结果表明,HMZ与ZJQ-221、Mammalian rubulavirus 5属于同一分支。

• 单位
  华南农业大学; 广州动物园