针对数字Stretch处理在大抽取倍数情况下硬件资源消耗大、难以工程实现的问题，提出了层叠分段快速傅里叶变换处理的数字Stretch实现算法，将数字混频后的数据序列通过层叠分段与重组，利用小点数的快速傅里叶变换运算实现数字Stretch处理。实测数据验证了算法的有效性。资源消耗分析表明，与常规的数据滤波抽取处理方法相比，该算法可有效减少数字Stretch处理的硬件资源消耗。
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