科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
通过对乳头状肾细胞癌(papillary renal cell carcinoma, PRCC)的miRNA表达芯片数据和基因表达芯片数据进行生物信息学分析,结合临床数据,研究PRCC的预后生物标志物。首先,利用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库下载的PRCC miRNA-seq数据筛选出差异表达的miRNA,并分析其与患者生存的相关度;然后,通过单因素Cox、LASSO以及多因素Cox回归,分析独立影响PRCC预后的mi RNA;随后,预测所选mi RNA的靶基因,并利用GEO (Gene Expression Omnibus)数据库下载的PRCC基因表达芯片数据验证上述靶基因表达与PRCC的相关性。生存分析表明,在PRCC组织样品中表达上调的mir-1293和mir-937可能与PRCC患者预后生存关系密切。机制分析提示, PRCC组织中mir-1293的高表达可能下调肿瘤抑制因子CLMN和DCN的表达, mir-937的高表达可能通过抑制ST6GAL1、ATP6V1A和VAV3的表达,促进PRCC的发生发展,导致预后不良。以上信息表明, mir-1293和mir-937的上调可能为不利的PRCC预后生物指标,可用于辅助判断患者预后情况。
- 单位
