针对现场合并单元SER软故障问题造成SV采样数据异常的情况,分析了SER软故障使合并单元失效的机理。提出双数据流的概念,采用数据处理冗余防误方法,解决了SER故障造成SV数据出错的问题。面对智能化变电站母线合并单元异常情况下控制保护设备大面积失压的问题,提出了母线合并单元配置冗余方案。采用双套母线合并单元电压接入间隔合并单元的无缝电压选择机制,解决了单套母线合并单元异常控制保护设备失压的问题,并在工程现场得到充分验证。