‘鄞红’葡萄HDR基因的克隆与生物信息学分析

作者：陈天池; 张巧; 王锦阳; 张敏; 肖旭腾; 董昳伶; 沈乐意; 李佳程; 姜雨琦; 吴月燕^*

来源：分子植物育种, 2023, 21(02): 409-419.

DOI：10.13271/j.mpb.021.000409

• ‘鄞红’葡萄
• HDR基因
• 萜类物质
• 生物信息学分析

4-羟基-3-甲基丁-2-烯基二磷酸还原酶(HDR)作为甲基赤藓醇磷酸(MEP)途径的关键酶，在植物萜类物质合成过程中起到极为重要的作用。为了了解HDR基因在植物体内发挥的特殊功能，以‘鄞红’葡萄为材料，利用RT-PCR等技术克隆了HDR基因全长，并对该基因进行生物信息学分析。结果显示，HDR基因全长为1 143 bp，编码380个氨基酸。通过多种软件比对分析，‘鄞红’葡萄与柑橘(Citrus sinensis)、南瓜(Manihot esculenta)、猕猴桃(Actinidia deliciosa)、黄瓜(Cucumis sativus)的相似性高达80%以上，亲缘关系较近。该结果为进一步研究‘鄞红’葡萄HDR的功能以及揭示该基因在植物萜类物质合成过程中发挥的作用提供了一定基础。

• 单位
  上海海洋大学; 浙江万里学院; 生命学院