EST-SSR标记构建莲(Nelumbo Adans.)遗传连锁图谱

作者:陈岳; 张微微; 莫海波; 付乃峰; 田代科
来源:分子植物育种, 2017, 15(06): 2265-2273.
DOI:10.13271/j.mpb.015.002265

摘要

本研究以美洲黄莲(Nelumbo lutea)为母本,亚洲莲单瓣品种‘单洒锦’(N.nucifera‘Dan Sajin’)为父本杂交获得的45株F1为作图群体,利用从莲转录组开发的211对EST-SSR标记和111对已报道的莲SSR标记,构建了莲遗传连锁框架图谱。该图谱包含8个连锁群,定位88个SSR标记,覆盖基因组420.7cM。连锁群的长度介于在7.082.0cM之间,连锁群上的标记数在423个之间。标记间平均图距为4.8cM,连锁群平均长度为52.6cM。6个偏分离标记集中定位在LG1、LG2和LG4上。该图谱为莲基因定位、图位克隆以及分子标记辅助选择育种等研究提供了一定的理论参考依据。

  • 单位
    中国科学院; 上海交通大学; 上海辰山植物园; 上海农林职业技术学院

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