基于关系图卷积网络的长链非编码RNA与疾病关联预测

作者：杜晓昕; 罗金琦; 金梅; 王振飞; 周薇

来源：现代信息科技, 2023, 7(07): 86-89.

DOI：10.19850/j.cnki.2096-4706.2023.07.022

• lncRNA
• 关系图卷积网络
• 异质图
• 关联预测

针对当前长链非编码RNA(lncRNA)与疾病关联预测研究中存在的异质网络构建不完善、网络节点信息挖掘不充分问题，提出一种基于关系图卷积网络（Relational Graph Convolutional Network, R-GCN）的方法（RGCNLDA）。首先，构建lncRNA-miRNA-疾病异质图，随后在异质图上训练R-GCN获取节点嵌入向量，最后使用多层感知机预测lncRNA-疾病关联。5折交叉验证结果显示，RGCNLDA的受试者工作特征曲线下面积（AUROC）为0.934，表明其具有良好的预测性能。

• 单位
  齐齐哈尔大学