新城疫病毒感染鸡胚组织miRNAs表达谱的测序及分析

作者：贾燕青; 仇薪鑫; 王相伟; 谢晓刚; 白军; 王兴龙; 杨增岐^*

来源：动物医学进展, 2022, 43(08): 19-24.

DOI：10.16437/j.cnki.1007-5038.2022.08.008

• 新城疫病毒
• small RNA测序
• miRNA
• 实时荧光定量PCR

为了阐明新城疫病毒(NDV)感染鸡胚后miRNAs表达谱的变化及NDV感染与宿主基因之间的相互作用，帮助寻找NDV防控的新靶点和方法。通过small RNA测序技术获得NDV强毒株(F48E9)和弱毒株(La Sota)感染的鸡胚内脏组织miRNAs表达谱。对差异表达的miRNAs进行分析发现，F48E9感染引起了33个miRNAs上调，31个miRNAs下调；La Sota感染引起36个miRNAs上调，25个miRNAs下调；La Sota与F48E9感染组比较，有27个miRNAs上调，22个miRNAs下调。选取10个差异表达miRNAs进行RT-qPCR验证，gga-miR-34a-5p、gga-miR-375、gga-miR-122-3p、gga-miR-187-3p、gga-miR-124a-3p、gga-miR-203a、gga-miR-205a、gga-miR-183、gga-miR-9-3p和gga-miR-451表达量与small RNA测序结果相似。对差异表达miRNAs进行靶基因预测和生物信息学富集分析发现，在NDV感染鸡胚时，差异表达的miRNAs主要参与调控细胞生长代谢、细胞周期及免疫和炎症反应等通路。研究结果分析了NDV感染后miRNAs表达变化及预测功能，为NDV防控研究提供参考。

• 单位
  西北农林科技大学; 杨凌职业技术学院