基于多种生物信息学数据探究BUB1基因在乳腺癌中的表达意义及双旋复花内酯甲的干预分析

作者：余旭; 周俞; 余春波^*

来源：中国实验方剂学杂志, 2021, 27(18): 152-159.

DOI：10.13422/j.cnki.syfjx.20210614

• 丝氨酸/苏氨酸激酶(BUB1)
• 乳腺癌
• Oncomine
• 双旋复花内酯甲
• 生物信息学

目的:探讨细胞周期有丝分裂纺锤体检测点丝氨酸/苏氨酸激酶(BUB1)基因在乳腺癌中的表达及与预后的关系,并进一步探究双旋复花内酯甲对乳腺癌细胞中BUB1基因的干预作用。方法:从Oncomine,GEPIA,GEO数据库,bc-GenExMiner v4.5和Kaplan-Meier Plotter数据库深入挖掘BUB1基因表达的相关数据,探寻BUB1基因在乳腺癌组织与正常乳腺组织中的表达差异及与患者预后的关系;利用癌症细胞系全科百科全书(CCLE)分析BUB1分别在乳腺癌组织T细胞和B细胞中的表达,利用STRING数据库绘制BUB1相关蛋白网络图及基因本体(GO)功能注释,并对京都基因和基因组百科全书(KEGG)相关通路进行分析。采用肿瘤免疫评估资源(TIMER)数据库分析BUB1在免疫浸润物中的表达及对乳腺癌患者生存预后的影响,最后,进一步分析双旋复花内酯甲对乳腺癌细胞中BUB1基因表达水平的影响。结果:(1)乳腺癌组织中BUB1的mRNA水平明显高于正常组织样本,但不同分子亚型的乳腺癌患者中BUB1的表达水平不同;(2)BUB1表达升高可导致luminal A亚型有较长的无转移生存期(DMFS),总体生存期(OS)和无复发生存率(RFS);(3)BUB1与染色质结构维持蛋白4(sSMC4)mRNA表达水平呈正相关,并可能与NUF2等10种蛋白相互作用且具有最强的相互作用关系;(4)在乳腺浸润癌(BRCA),BRCA-基底细胞(basal)中CD8+T细胞、中性粒细胞中BUB1 mRNA高表达相对于低表达组的患者2年生存预后较好;在BRCA-HER-2中B细胞中BUB1 mRNA低表达相对于高表达组的患者2年生存预后较好;(5)GEO数据库分析数据集GSE85871发现旋复花内酯甲可使乳腺癌MCF7细胞BUB1基因表达下调。结论:乳腺癌组织中BUB1基因呈现高表达,且与乳腺癌的预后及免疫细胞浸润相关,这可能是双旋复花内酯甲干预乳腺癌细胞的一个新的潜在治疗靶点。

• 单位
  遵义医科大学; 基础医学院; 遵义市第一人民医院