基于TCGA数据库的乳腺癌进程关键基因系统筛选和鉴定

作者：冯旭; 赵丽敏; 柯浩; 张洪磊

来源：郑州大学学报(理学版）, 2017, 49(04): 93-99.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6841.2017121

• 转录组
• TCGA数据库
• SGOL1

利用TCGA数据库收集的乳腺癌转录组数据和病人临床信息,分析基因表达与乳腺癌临床病理学参数的相关性及其对预后的影响,同时结合表达差异分析筛选出与乳腺癌进程密切相关的7个候选基因(UBE2T、RRM2、SGOL1、ERCC6L、CCNE1、HMGB3和SPDYC).通过基因功能注释检索确定SGOL1作为实验验证的候选基因.实验结果表明在乳腺癌细胞系MDA-MB-231中敲降SGOL1能显著抑制细胞生长,细胞周期被阻滞在G2/M期.上述结果表明SGOL1在乳腺癌进程中具有重要作用,同时也说明该生物信息结合实验的筛选方法可以加速肿瘤关键基因的筛选和鉴定.

• 单位
  生命科学学院; 遗传资源与进化国家重点实验室; 中国科学院大学; 中国科学院昆明动物研究所; 昆明理工大学