Streptomyces bacillaris ATCC 15855T中bafilomycin A1合成基因簇的挖掘

作者：赵守静; 高坤鹏; 刘振^*; **朝

来源：工业微生物, 2019, 49(06): 18-25.

• T" name="keyword">Streptomyces bacillaris ATCC 15855T
• 全基因组序列
• Bafilomycin A1
• 次级代谢产物
• 基因簇

Bafilomycin A1是大环内酯类抗生素,具有广泛的抗癌活性。通过HPLC及HPLC-MS分析Streptomyces bacillaris ATCC 15855T的发酵产物,结果显示S.bacillaris ATCC 15855T发酵能够产生bafilomycin A1。S.bacillaris ATCC 15855T分离自中亚土壤。通过全基因组测序,获得了S.bacillaris ATCC 15855T的完整基因组序列。该基因组由6 957 417 bp的线性染色体组成,GC含量为72.29%。该染色体预测了7 284个开放阅读框架(ORF),18个rRNA操纵子,64个tRNA基因。通过antiSMASH v 4.0.3分析,共预测了39个生物合成基因簇。其中,具有抑制液泡型H(+)ATP酶的bafilomycin A1基因簇与已报道的基因簇相似度为100%。在bafilomycin A1合成基因簇中有19个ORFs。

• 单位
  中国海洋大学