苦荞FtERD家族糖转运基因的鉴定与分析

作者：梁成刚; 韦春玉; 汪燕^*; 关志秀; 邓娇; 黄娟; 石桃雄

来源：福建农林大学学报（自然科学版）, 2021, 50(06): 734-740.

DOI：10.13323/j.cnki.j.fafu(nat.sci.).2021.06.003

• 苦荞
• 早期脱水响应基因
• 糖转运载体
• 生物信息学
• 基因表达

利用生物信息学方法筛选鉴定出28个FtERDs糖转运基因,其中19个编码蛋白序列且具有跨膜结构域.聚类分析将FtERDs归为4类,类Ⅰ包括13个,类Ⅱ包括9个,类Ⅲ包括1个,类Ⅳ包括5个.转录组测序检测到22个FtERDs在茎中表达,17个为差异表达基因(DEGs),其中仅3个DEGs在苗期10和15 d同时高表达,其余有3个DEGs在5 d高表达,2个DEGs在10 d高表达,9个DEGs在15 d高表达.这些基因可能在不同发育阶段的茎中发挥功能.同时,FtERDs间存在多个显著正相关或负相关,推测FtERDs基因的功能可能存在协同或互补效应.PEG模拟干旱胁迫8 h时,5个FtERDs过量表达,其中FtPinG34458.01、FtPinG85532.01表达量高于对照10倍以上.

• 单位
  生命科学学院; 贵州师范大学