牦牛UCP3基因编码区克隆及肌肉表达谱分析

作者：叶娜; 马启财; 王兴东; 张振宇; 常永芳; 阎萍; 潘和平^*

来源：基因组学与应用生物学, 2020, 39(12): 5403-5410.

DOI：10.13417/j.gab.039.005403

• 牦牛(Bos grunniens)
• 解偶联蛋白3基因
• 生物信息学
• mRNA表达

本研究旨在对大通牦牛的解偶联蛋白-3 (UCP3)基因克隆及生物信息学分析,利用RT-PCR技术获得牦牛UCP3基因CDS序列,并对牦牛UCP3的蛋白质结构和氨基酸序列进行生物信息学分析,采用q RT-PCR技术检测UCP3基因在牦牛肌肉不同发育阶段的表达情况。克隆结果表明,牦牛UCP3基因的开放阅读框(open reading frame, ORF)长939 bp编码312个氨基酸。与NCBI中公布的黄牛UCP3 (NM174210)基因的同源性为99.25%,氨基酸同源性为99.04%。牦牛UCP3基因的氨基酸序列与其他几种哺乳动物有较高的同源性。系统进化树分析发现牦牛与黄牛亲缘关系最近,与爪蟾亲缘关系最远。牦牛UCP3基因编码产物具有亲水性和不稳定性,二级结构以α-螺旋为主,主要定位于细胞质,不存在信号肽剪切位点,属非分泌蛋白;存在3个跨膜螺旋结构,26个磷酸化修饰位点。qRT-PCR结果显示,UCP3 mRNA所检测到大通牦牛腿肌的不同发育时期都有表达,其中以成年牛的表达量为最高,显著高于胎牛时期(p<0.05),6月龄的表达水平次之,胎牛几乎不表达。本研究为后期牦牛的育种提供一定的科学依据。

• 单位
  中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所; 西北民族大学