科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
目的 探讨HOXA基因簇各蛋白编码基因mRNA表达水平及与预后的关系。方法 采用生物信息学方法分析癌症基因组图谱(TCGA)＿GBMLGG数据库中669例不同级别胶质瘤和TCGA＿GBM数据库中489例胶质母细胞瘤组织HOXA基因簇编码基因mRNA的表达情况，分析其与胶质瘤临床病理分级和预后的关系。纳入2011年1月至2015年12月经术后病理证实的70例胶质瘤组织和手术切除的正常脑组织20例，采用实时荧光定量PCR(qPCR)检测HOXA基因簇各蛋白编码基因在胶质瘤中的表达水平，并分析其与总生存时间(OS)的关系。结果 HOXA基因簇由HOXA1、HOXA2、HOXA3、HOXA4、HOXA5、HOXA6、HOXA7、HOXA9、HOXA10、HOXA11、HOXA13共11个蛋白编码基因组成。TCGA＿GBMLGG数据库分析显示，HOXA基因簇中11个编码基因的相对表达量随胶质瘤级别的升高而升高，在Ⅳ级胶质瘤中的相对表达量高于Ⅱ～Ⅲ级(P<0.001)。在胶质母细胞瘤组织中，除HOXA6基因外，其他10个基因的相对表达量均高于正常脑组织(P<0.001)。HOXA基因表达水平在胶质母细胞瘤组织中最高，其次为星形细胞瘤，最少为少突星形细胞瘤和少突神经胶质瘤。HOXA基因簇在IDH1野生型胶质瘤中的表达水平均高于IDH1突变型胶质瘤(P<0.001)。HOXA基因簇高表达与较短的OS有关(P<0.001)。在70例临床胶质瘤组织中，Ⅱ～Ⅲ级、Ⅳ级胶质瘤组织中HOXA基因簇的相对表达量高于20例正常脑组织，其表达水平随胶质瘤级别的升高而升高(P<0.05)。70例临床胶质瘤患者的中位OS为20.9个月，HOXA基因低表达组患者的中位OS明显优于高表达组(P<0.001)。结论 胶质瘤组织中HOXA编码基因表达水平升高，可能参与了胶质瘤的发生、发展过程；HOXA基因簇高表达是预后不良因素，可作为预测预后的生物标志物。
- 单位
