幽门螺杆菌根除者胃内菌群特征及其与CXCL17相关性

作者：李司柱; 肖士渝; 薛艳; 周丽雅^*

来源：胃肠病学和肝病学杂志, 2021, 30(08): 883-892.

DOI：10.3969/j.issn.1006-5709.2021.08.008

• 幽门螺杆菌
• 胃内菌群
• 高通量测序
• CXCL17

目的通过比较幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,H.pylori)根除成功者、H.pylori感染者及无H.pylori感染史者胃内菌群差异,探讨H.pylori根除对胃内菌群的影响。方法选取6例H.pylori根除成功者、12例H.pylori感染者和13例无H.pylori感染史者胃黏膜标本,研磨匀浆组织后提取基因组,扩增16S rDNA基因V3～V4高变区,构建425 bp左右扩增片段,基于Illumina Miseq PE250测序平台测序。测序数据经过生物信息处理,通过97%一致性将序列聚类得到OTU,经聚类及物种注释后获得每个样本在各分类水平的分布情况。三组样本进行α多样性和β多样性分析,统计分析三组胃黏膜菌群差异。此外,通过物种差异与关联分析预测差异菌属与CXCL17关系及差异功能通路。结果 H.pylori根除成功组与无H.pylori感染史组胃黏膜菌群结构相似。与H.pylori感染组相比,α多样性分析后者胃黏膜菌群多样性显著降低,但菌群丰度无差异。β多样性结果显示,各组组内的菌群结构相似度高,而前两组组间菌群结构相似且与后者组间的菌群相似度较低。胃黏膜趋化因子CXCL17与棒状杆菌属(Corynebacterium)和微球菌属(Micrococcus)呈负相关。胃液趋化因子CXCL17与普氏菌属(Prevotella)呈负相关。各组间代谢途径存在差异且有H.pylori感染史组涉及更多疾病相关代谢途径,而无H.pylori感染史组则无。结论 H.pylori感染导致胃黏膜菌群发生紊乱,根除H.pylori能逆转这种改变,使胃黏膜菌群恢复至与无H.pylori感染史者相似状态。抗菌趋化因子CXCL17与胃内部分菌群具有相关性,提示胃内菌群与机体局部免疫系统可能互相作用。

• 单位
  北京大学第三医院