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摘要
目的研制生物信息学软件,分析内质网应激相关基因DDIT3在成骨细胞中的表达调控。方法采用java语言编制能够从NCBI的高通测序数据库中比对特定序列的软件工具,利用该软件进行统计分析DDIT3的表达丰度、染色质活化程度及其受miRNA调控程度。结果开发软件工具无需安装且操作简单。成骨细胞中DDIT3的转录变体丰度不同,在染色质活化程度较低,且受miRNA调控程度也较低。结论本文开发的软件工具适用于从NCBI的SAR全基因高通测序数据库中研究个别基因的转录调控。
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单位生物医学工程学院; 首都医科大学
