慢性血栓栓塞性肺动脉高压显著相关的微RNA

作者:缪冉; 董星琲; 龚娟妮; 李积凤; 庞文翼; 刘岩岩; 杨媛华*
来源:中华医学杂志, 2018, 98(18): 1397-1402.
DOI:10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2018.18.006

摘要

目的探索与慢性血栓栓塞性肺动脉高压(CTEPH)显著相关的微RNA(miR)。方法通过整合Affymetrix miR芯片数据以及从高通量基因表达数据库(GEO)公共数据库上下载的GSE56914数据。两套芯片数据均来自于CTEPH患者和匹配的健康受试者的外周血标本。筛选两套数据中的差异表达miR,搜索这些miR的靶基因。并对这些miR进行功能富集分析。最后构建了包括miR、靶基因和通路的疾病关联网络。结果筛选出hsa-miR-885-5p、hsa-miR-501-5p、hsa-miR-615-3p、hsa-miR-610和hsa-miR-346等5个对该疾病起重要作用的miR,而且这5个miR在两个数据集中均为显著下调。hsa-miR-885-5p和hsa-miR-501-5p显著参与细胞周期通路,hsa-miR-615-3p显著参与细胞因子-细胞因子受体相互作用,轴突导向,黏着斑和细胞周期通路,hsa-miR-610显著参与黏着斑通路,hsa-miR-346显著参与细胞因子-细胞因子受体相互作用,轴突导向和黏着斑通路。结论 hsamiR-885-5p、hsa-miR-501-5p、hsa-miR-615-3p、hsa-miR-610和hsa-miR-346是与CTEPH显著相关的miR。

  • 单位
    首都医科大学附属北京朝阳医院; 四川大学

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