鼠疫耶尔森菌基因组核糖体结合部位识别

作者：王宇萌; 俞东征

来源：中国媒介生物学及控制杂志, 2012, (06): 503-505+511.

• 核糖体结合位点
• 翻译起始
• 鼠疫耶尔森菌 Ribosomal binding site
• Translation initiation
• Yersinia pestis

目的通过统计分析鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)CO92株中核糖体结合位点(RBS)与翻译起始位点的距离,探索最适合翻译起始的RBS与起始位点的距离。方法通过对鼠疫菌所有拷贝的16SrRNA3′端,及已经通过实验确定的177处RBS进行分析,确定鼠疫菌RBS的序列特征。统计鼠疫菌CO92株中存在的所有RBS序列的位置和数量,及RBS序列与翻译起始序列ATG(GTG,TTG,CTG)的距离。观察已经公布的CO92株的编码序列(CDS)片段前20个碱基序列的特征。结果在CO92的全基因组序列中搜索,共发现可能的RBS结构5081个,2909个后面一段距离内存在开放读码框架,其中1541与标注的CDS相符,5...

• 单位
  传染病预防控制国家重点实验室; 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所