高粱病程相关蛋白基因的鉴定及荧光定量PCR引物筛选

作者:邵玉涛*; 刘丹; 郭磊; 王振杰; 裴海霞
来源:分子植物育种, 2020, 18(19): 6392-6398.
DOI:10.13271/j.mpb.018.006392

摘要

病程相关蛋白(pathogenesis-relatedproteins, PRs)在植物抗病反应中扮演着重要角色,然而,目前关于其在高粱抗蚜反应中是否发挥作用还不是很明确。为探究高粱抗蚜反应中病程相关蛋白的作用,需利用荧光定量PCR (fluorescent quantitative PCR, qPCR)的方法对该类基因的表达量变化进行检测,而PCR引物的筛选将直接影响到检测结果的准确性。本研究通过对蚜虫侵染高粱材料的转录组数据进行分析,筛选出17个病程相关蛋白基因,利用qPrimerDB数据库网站查找到17对引物。利用PCR和荧光定量PCR的方法,双重验证引物的特异性。最终筛选出6个基因的6对引物峰值单一,特异性和扩增效率均较为理想,可用于后续研究这些基因的表达模式变化,揭示病程相关蛋白在高粱抗蚜反应中的作用,为开展主要农作物抗虫分子育种提供理论依据。