河南省结核分枝杆菌MIRU-VNTR和间隔区寡核苷酸分型分析

作者：石洁; 郑丹薇; 朱岩昆; 马晓光; 王少华; 李辉; 张国龙^*

来源：郑州大学学报(医学版), 2019, 54(03): 425-430.

DOI：10.13705/j.issn.1671-6825.2018.09.131

• 结核分枝杆菌
• MIRU-VNTR
• 间隔区寡核苷酸分型
• 河南省

目的:调查河南省结核分枝杆菌分子流行病学的结构特征。方法:共纳入河南地区668株结核分枝杆菌,进行间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和26位点分枝杆菌散在重复单元-数目可变串联重复序列(MIRU-VNTR)分型分析,评估不同MIRU-VNTR位点组合的分辨效能。结果与结论:北京家族基因型菌株有558(83. 53)株,是河南省最流行的结核分枝杆菌,其中典型北京家族基因型(SIT1)是最具优势的基因型(512株,88. 89%)。26位点MIRU-VNTR可将668株菌分成567种基因型,其中含有38个基因簇和529种独立的基因型。累积Hunter-Gaston分辨力指数表明10个分辨力最强VNTR位点组合的分辨效力接近26位点组合。

• 单位
  河南省疾病预防控制中心