摘要
印度梨形孢(Piriformospora indica)在促进植物生长发育、增强植物抗生物及非生物胁迫方面发挥重要作用。circRNA在植物生长发育过程中具有重要调控功能。本研究旨在揭示circRNA在印度梨形孢促进大麦根部生长发育过程中的调节机制。基于全转录组测序和生物信息学技术在大麦中共鉴定出1 100个circRNA。在3 dai (day after P. indica colonization) vs Mock (对照)组,有33个差异表达的circRNA (differentially expressed circRNAs, DE circRNA),其中19个circRNA表达上调,14个circRNA表达下调;在7 dai vs Mock组,有49个DE circRNA,36个上调,13个下调;在7 dai vs 3 dai组,有44个DE circRNA,36个上调,8个下调。KEGG富集分析结果表明,多数DE circRNA参与新陈代谢和次生代谢产物生物合成过程。基于circRNA-mRNA、circRNA-miRNA和miRNA-mRNA的共表达相关性,为3 dai vs Mock组与7 dai vs Mock组构建了一个miRNA-circRNA-mRNA网络;代谢组学数据验证了转录组测序结果。本研究以circRNA为出发点,探究了circRNA在印度梨形孢促进大麦生长发育中的调节机制,为揭示印度梨形孢促生机制提供新的思路和方向。
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