蒺藜苜蓿LBD转录因子基因家族全基因组分析

作者：贾喜涛; 刘文献; 谢文刚; 刘志鹏; 刘志敏; 王彦荣

来源：西北植物学报, 2014, 34(11): 2176-2187.

• 蒺藜苜蓿
• LBD转录因子
• 系统进化
• 基因表达分析

LBD是植物中所特有的转录因子基因家族,在调控植物侧生组织发育、营养代谢以及响应逆境胁迫等方面具有重要作用。该研究利用生物信息学手段,从全基因组水平筛选和鉴定了蒺藜苜蓿LBD基因家族,并对基因结构、系统进化、进化压力、保守域、染色体定位以及基因表达模式等进行了分析。研究结果共鉴定出2类5亚类共计56个蒺藜苜蓿LBD家族基因,在8条染色体上均有分布,但分布不均匀。该家族成员外显子数目都不超过2个,结构简单,基因间在进化时存在负向选择作用。基因表达模式分析发现,该家族成员的表达具有一定的时空特异性,并受干旱和氮素调控。该研究结果对蒺藜苜蓿LBD基因功能研究及进化分析具有重要的意义。

• 单位
  草地农业科技学院; 兰州大学; 草地农业生态系统国家重点实验室