苹果Ty1-copia类逆转座子家族鉴定及特性分析

作者：孙俊; 房经贵; 孙其宝; 章镇

来源：西北植物学报, 2009, (12): 2373-2377.

• 苹果
• Ty1-copia类逆转座子
• 逆转录酶
• 进化 apple
• Ty1-copia-like retrotransposons
• reverse transcriptase
• evolution

根据逆转座子RT保守序列设计引物,利用PCR方法从苹果‘嘎拉’中克隆了20条RT片段,分析苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子家族特性及进化关系。结果显示,20条逆转录酶保守序列表现出了高度的异质性。结合已报道的37条苹果Ty1-copia类逆转座子RT片段,构建了系统发育树,发现家族1、3和4中具有转座活性的逆转座子的可能性较大;序列分析表明,Ty1-copia类逆转座子是苹果基因组内序列重组的热点。用RT序列为探针进行Southern杂交,发现苹果基因组内Ty1-copia类逆转座子拷贝数高、分布广泛。研究结果为进一步分离具有转座活性的苹果Ty1-copia类逆转座子及其人工诱导芽变奠...

• 单位
  南京农业大学; 安徽农业大学; 安徽省农业科学院园艺研究所