基于全基因组测序平均核苷酸一致性的生胞梭菌(Clostridium sporogenes)鉴定

作者：曹艳花; 冯会粉; 程坤; 刘波; 都海渤; 谢九艳; 辛迪; 姚粟^*

来源：食品与发酵工业, 2022, 48(19): 44-49.

DOI：10.13995/j.cnki.11-1802/ts.031023

• 生胞梭菌
• CICC 10385
• CMCC 64941
• 全基因组测序
• 平均核苷酸一致性

基于全基因组测序通过平均核苷酸一致性鉴定生胞梭菌(Clostridium sporogenes)CICC 10385(=CMCC 64941)至种水平。通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 10385的基础信息，并采用BGISEQ-500基因测序仪进行全基因组测序分析全基因组平均核苷酸一致性。结果显示，菌株CICC 10385的基因组大小为4 252 276 bp,含有58个contigs,基因组(G+C)mol%为27.9%。该菌16S rRNA基因序列与生胞梭菌(C.sporogenes)、肉毒梭菌(C.botulinum)、孔氏梭菌(C.combesii)和C.tepidum最为相似，平均核苷酸一致性(average nucleotide identity, ANI)分析显示，该菌与生胞梭菌(C.sporogenes)DSM 795T(GCA＿001020205.1)ANI值为99.39%,与梭菌属其余菌种ANI值均低于95%,可将CICC 10385鉴定为生胞梭菌(C.sporogenes)。基于全基因组测序的ANI分析是一种准确有效的菌种鉴定方法，为该菌及梭菌属(Clostridium sp.)相关菌种鉴定研究提供了理论依据，为该菌的生物学功能研究奠定了基础。

• 单位
  中国食品发酵工业研究院有限公司