稻虾模式下克氏原螯虾组织及其养殖环境菌群多样性

作者：王飞飞; 王夏雯; 金倩; 张智慧; 王信海^*

来源：青岛农业大学学报(自然科学版), 2021, 38(02): 91-97.

• 稻虾共作
• 克氏原螯虾
• 组织
• 养殖环境
• 菌群结构
• 高通量测序

采用基于Illumina Hiseq的高通量测序技术,对稻虾共作模式下克氏原螯虾(procambarus clarkii)肠道、肝胰腺、鳃及其养殖池塘水体、底泥中菌群多样性进行了研究。测序结果显示,5个样品共获得有效序列393 519条,抽平后(48 659)聚类于7 223个分类操作单元(Operational Taxonomic Units,OTU),归属于克氏原螯虾肠道、肝胰腺、鳃、养殖水体、池塘底泥样品的OTU个数分别为1 447、1 559、831、741和2 064,其中共有OTU 248个。Alpha多样性分析显示底泥、肝胰腺和肠道多样性指数较高,鳃和水体多样性指数较低。物种注释结果显示,克氏原螯虾肠道中优势细菌种类为厚壁菌门(42.16%)、变形菌门(13.78%)和柔膜菌门(13.07%);肝胰腺优势细菌种类为厚壁菌门(54.52%)、变形菌门(10.69%)和放线菌门(10.6%);鳃优势细菌种类为变形菌门(91.54%)、拟杆菌门(3.34%)和厚壁菌门(2.72%);水体优势细菌种类为放线菌门(46.31%)、变形菌门(33.33%)和拟杆菌门(13.47%);底泥优势细菌种类为变形菌门(40.18%)、绿弯菌门(18.14%)和厚壁菌门(9.88%)。此外,在属水平上各样品中的优势细菌种类差异较大。主坐标分析(Principal coordinates analysis,PCoA)分析发现底泥、肝胰腺、肠道微生物群落结构相似度较高,水体、鳃与其他样品微生物群落结构相似度较低。试验结果表明:克氏原螯虾肠道、肝胰腺、鳃与其养殖环境中菌群结构存在着一定的相关性,但各样品优势菌群差异较大。

• 单位
  江苏省农业科学院