基于生物信息学分析幽门螺杆菌感染与骨质疏松症的相关性

作者：唐杨; 邵高海^*

来源：现代医药卫生, 2023, 39(19): 3257-3262.

• 骨质疏松症
• 幽门螺杆菌
• 生物信息学
• 信号通路

目的 利用生物信息学分析幽门螺杆菌(HP)感染与骨质疏松症(OP)的关系。方法 通过Disgenet、OMIM、TTD、GeneCards、Pharmgkb等基因数据库查找引起OP和HP感染的疾病基因，构建疾病共同基因的蛋白互作网络并筛选出关键靶点基因，通过DAVID数据库进行基因本体论(GO)功能和京东基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 通过相关基因数据库筛选出获得OP相关基因493个，HP感染相关基因798个，通过取交集后获得69个HP感染与OP共同靶点基因。GO功能主要富集在序列特异性DNA结合转录因子活性的正向调节、Ⅰ-κB激酶/核因子κB信号传导等方面，KEGG通路包括人巨细胞病毒感染、沙门菌感染等信号通路。HP感染与OP的关键靶点基因为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、清蛋白、CTNNB1、雌激素受体1、白细胞介素1B、白细胞介素6、瘦素、基质金属蛋白酶-9、MYC、肿瘤坏死因子等。结论 HP感染多通过导致炎性反应产生炎症因子，从而作用于影响骨吸收及骨形成的信号通路，最终导致或加重OP。

• 单位
  重庆医科大学附属永川医院