大麦AMT1基因家族的全基因组分析

作者：李赢; 王爽; 万华; 吕超; 王菲菲; 郭宝健; 许如根^*

来源：分子植物育种, 2019, 17(11): 3461-3467.

DOI：10.13271/j.mpb.017.003461

• 大麦
• 铵盐转运蛋白
• 进化树
• 表达谱

植物铵转运蛋白(ammonium transporter, AMT)基因家族是重要的吸收与同化铵盐的基因家族,对调节植物的生长发育有重要的作用。AMT1基因家族属于高亲和铵态氮转运蛋白。为了解大麦AMT1基因家族成员在染色体上的分布、基因结构及组织表达性差异,本研究以公布的大麦栽培品种Morex的基因组数据为基础,在全基因组水平上采用生物信息学方法,以水稻、玉米、高粱、大豆、二穗短柄草和拟南芥AMT1基因家族为参考序列,利用同源比对的方法鉴定了大麦AMT1基因家族。结果表明,共鉴定出了5个AMT1基因,分别位于2H (HvAMT1.1, HvAMT1.2, HvAMT1.3)、3H (HvAMT1.4)和6H (HvAMT1.5)上,且这5个AMT1基因具有相似的编码区和核苷酸长度,串联重复事件是大麦AMT1基因家族的主要扩张方式;大麦AMT1基因的基因结构相似,不含内含子,只包含一个外显子;不同组织器官中HvAMT1基因的表达存在明显的差异,大麦HvAMT1.1和HvAMT1.3基因主要在幼苗期的根、茎和成熟期的衰老叶片中表达,大麦HvAMT1.5基因主要在大麦根系中表达,HvAMT1.2和HvAMT1.4基因在大麦所有组织器官中表达量都很低。本研究结果为大麦HvAMT1基因功能的解析提供了一定的参考。

• 单位
  江苏省作物遗传生理重点实验室; 扬州大学