基于ceRNA探讨白藜芦醇干预肾透明细胞癌的有效机制

作者：谢天琪; 裴丽霞; 宋亚芳; 孙梦珠; 赵婷婷; 易越; 孙建华^*

来源：世界科学技术-中医药现代化, 2020, 22(12): 4285-4292.

• 肾透明细胞癌
• ceRNA网络
• 白藜芦醇

目的利用从肾透明细胞癌(ccRCC)数据集中筛选的差异表达基因、差异lncRNA及其上游miRNA,探索白藜芦醇可能的作用靶点,构建ccRCC的ceRNA网络。方法从基因表达综合数据(GEO)及转录组数据库(TCGA)中检索并筛选ccRCC基因及lncRNA表达数据集,对差异表达基因(DEGs)进行富集和功能注释,使用在线数据库预测miRNA及长链非编码RNA(lncRNA),通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)鉴定该机制中可能的lncRNA,建立竞争性内源性RNA(ceRNAs)调控网络,并通过网络药理学分析确定白藜芦醇的药物靶点,探索白藜芦醇治疗ccRCC的分子作用机制。结果构建了AL136040.1、SNHG17与上游hsa-miR-25-3p、hsa-miR-23a-3p及COL1A2、HRG的ceRNA调控网络,白藜芦醇与两个mRNA均显示良好的对接打分。结论可能存在AL136040.1、SNHG17两个lncRNA与hsa-miR-25-3p、hsamiR-23a-3p竞争性调控COL1A2、HRG,进一步影响ccRCC预后,可能是白藜芦醇治疗ccRCC的潜在机制。

• 单位
  南京中医药大学