2016—2017年宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒感染状况及重组类型分析

作者：党文; 马江涛; 陈慧; 袁芳; 马学旻; 詹军^*

来源：中华预防医学杂志, 2019, 53(08): 811-816.

• 诺罗病毒
• 基因型
• 监测
• 基因重组

目的了解宁夏急性胃肠炎患者中诺如病毒的感染状况及其重组现象。方法研究对象为2016年1月至2017年12月在宁夏5个市10家监测点医疗机构门急诊就诊的急性胃肠炎病例,共2 334例。收集病例临床资料和患者个人信息,采集粪便标本后统一送往宁夏疾病预防控制中心,采用实时荧光定量PCR方法进行核酸检测,采用逆转录PCR对诺如病毒GⅡ型阳性标本的聚合酶区和衣壳蛋白区进行扩增、测序及基因分型,用MEGA-X软件进行进化分析,并用Simplot 3.5.1和RDP4软件进行重组分析。结果 2 334例病例的年龄M(P25,P75)为1.42(0.68,7.69)岁;2016和2017年分别为1 133和1 201例;男女分别为1 343和991例;诺如病毒GⅠ型阳性率为0.86%(20例),GⅡ型为14.82%(346例)。346株GⅡ型毒株中有78株重组毒株完成测序,共发现12种重组类型,其中GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,分别占35.90%(28株)和32.05%(25株),其次为GⅡ.P16/GⅡ.2,占12.82%(10株);首次在宁夏检出GⅡ.P7/GⅡ.6(2株)、GⅡ.P12/GⅡ.3(6株)、GⅡ.P16/GⅡ.1(2株)、GⅡ.P16/GⅡ.2(5株)、GⅡ.Pe/GⅡ.4(7株)型重组株,均为型间重组,重组位点多位于ORF1区。结论 2016—2017年宁夏诺如病毒感染以GⅡ组为主,且均为重组株,GⅡ.Pe/GⅡ.4Sydney2012和GⅡ.P12/GⅡ.3为主要流行株,其次为GⅡ.P16/GⅡ.2。

• 单位
  宁夏医科大学; 宁夏疾病预防控制中心