基于转录组测序的放射性肠损伤基因动态变化

作者：王津晗; 路倩颖; 纪凯华; 杜利清; 王彦; 徐畅; 刘强

来源：中华放射医学与防护杂志, 2018, 38(02): 81-86.

DOI：10.3760/cma.j.issn.0254-5098.2018.02.001

• 转录组测序
• 放射性肠损伤
• 差异表达基因
• 信号通路
• 基因相互作用网络

目的探讨致死剂量的电离辐射对小鼠空肠组织转录组动态变化。方法小鼠经14 Gy137Csγ射线腹部照射后,分别于6 h,3.5和5 d提取各组小鼠空肠总RNA进行转录组测序。表达变化倍数在2倍以上即视为显著差异,对表达差异的基因进行IPA、Funrich、GO和KEGG软件分析。结果小鼠在腹部照射后6 h和3.5 d共同激活了p53信号通路。在照射后第3.5天的差异基因中,基因相互作用网络分析结果表明,Lck、Cdk1和Fyn可能起关键作用,通路分析表明,上调了DNA损伤修复信号通路,下调了细胞黏附分子、黏着斑和IgA分泌途径信号通路。结论 p53信号通路以及Lck、Cdk1和Fyn等基因在放射性肠损伤中可能起关键作用。

• 单位
  放射医学研究所; 中国医学科学院北京协和医学院