山西省2018-2020年猪圆环病毒3型的检测及Cap基因遗传演化分析

作者：孟帆; 薛翼鹏; 赵岳; 米瑞娟; 吴忻^*

来源：中国兽医学报, 2023, 43(09): 1793-1799.

DOI：10.16303/j.cnki.1005-4545.2023.09.01

• 猪圆环病毒3型
• ORF2基因
• 遗传变异分析

为了掌握近年来山西省猪圆环病毒3型(PCV3)的分子流行病学情况，运用PCR技术对2018-2020年在山西省猪场采集的1 125份血清和病、死猪组织样品进行PCV3检测，然后对获得的5份PCV3阳性样品ORF2序列进行测序，并对ORF2序列和推导出的Cap蛋白氨基酸序列进行遗传进化分析。结果发现，PCV3在山西省猪场感染严重，山西省2018-2020年PCV3平均阳性率为21.42%,猪场平均阳性率为44.17%,且猪场PCV3型的平均阳性率有呈逐年上升的趋势；测序发现山西省5株PCV3的ORF2核酸序列均为645 bp,编码214个氨基酸，5株PCV3 ORF2之间核苷酸和Cap蛋白氨基酸同源性分别为99.2%～100.0%和98.1%～100.0%,与36株参考株之间核苷酸和氨基酸同源性分别为98.1%～99.8%和97.2%～100.0%;PCV3的ORF2核酸序列遗传进化分析表明，山西省5株PCV3流行株都属于PCV3b亚型，由此可见目前山西省PCV3流行株主要为PCV3b亚型。5株PCV3 Cap蛋白氨基酸序列较为保守，没有出现不同于其他毒株的特异性突变。本研究结果为了解PCV3在山西省的流行和遗传进化特点提供了理论依据，也为山西省PCV3的科学防控奠定了基础。

• 单位
  山西农业大学