蛋白质二维红外相干光谱的理论研究(英文)

作者：宋建; 庄巍

来源：化学进展, 2012, (06): 1065-1081.

• 多肽
• 非线性响应
• 酰胺振动模式
• 二维红外光谱 peptides
• nonlinear response
• amide vibration
• 2DIR

多肽对红外激光脉冲的非线性响应中包含了丰富的结构动力学信息。本文以肽链的酰胺振动跃迁为例,提出了模拟二维红外相干光谱的理论方案。文中首先介绍了激子模型下非线性响应的微扰图像,并基于激子模型、经典分子动力学模拟和密度泛函静电势,构建酰胺振动模式有效波动哈密顿量。采用随机刘维尔方程(SLE)、数值演化(NP)、高斯波动的累积展开(CGF)等方法计算非线性响应光谱。文章最后对多肽及多肽复合物等体系的二维红外信号进行模拟和讨论。

• 单位
  分子反应动力学国家重点实验室; 中国科学院