TCMSP数据库中药化学成分的SARS-CoV-2主蛋白酶抑制剂虚拟筛选

作者：史海龙; 黄月; 程怡; 史永恒; 王川; 刘继平; 王斌^*

来源：中药新药与临床药理, 2022, 33(02): 219-227.

DOI：10.19378/j.issn.1003-9783.2022.02.011

• SARS-CoV-2
• 主蛋白酶(Mpro)
• 分子对接
• 虚拟筛选
• 分子动力学模拟

目的 运用计算机模拟技术从中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）的中药化学成分中挖掘SARS-CoV-2主蛋白酶（Main protease,Mpro）抑制剂。方法 运用类药性评估、分子对接、ADME预测、结合自由能计算、分子动力学模拟等多轮虚拟筛选的策略，从TCMSP数据库中筛选Mpro抑制剂。结果 共筛选得到10个命中分子，其中前3位最佳命中分子为MOL003392、MOL011716、MOL002966，表现出与靶标活性口袋关键氨基酸残基的强相互作用。结论 该研究可为发现SARS-CoV-2 Mpro小分子抑制剂提供新的思路。

• 单位
  陕西中医药大学